Search results for "Molekulārā dinamika"
showing 5 items of 5 documents
NiO režģa dinamikas pētījumi ar apgriezto Monte-Karlo metodi
2022
NiO režģa dinamika tika izpētīta pie septiņām temperatūrām no 10K līdz 300K, izmantojot Ni K malas rentgenabsorbcijas spektroskopiju apvienojumā ar apgrieztā Monte Carlo simulācijām. Salīdzinājumam veica režģa dinamikas aprēķinus ar empīrisko potenciālu. Potenciāla modeli apstiprināja, salīdzinot eksperimentālos NiO Ni K malas izstieptās rentgenabsorbcijas sīkstruktūras (EXAFS) spektrus ar molekulārās dinamikas modelēšanas rezultātiem pie 300 K. Ni-O un Ni-Ni atomu pāru vidējās kvadrātiskās relatīvās nobīdes (MSRD) noteica ar divām metodēm un salīdzināja ar literatūrā pieejamajiem datiem.
Molekulārās dinamikas trajektorijas analīzes koda izstrāde fluorbenzoskābju pašasociācijas pētījumiem
2020
Molekulārās dinamikas trajektorijas analīzes koda izstrāde fluorbenzoskābju pašasociācijas pētījumiem. Auziņš A. A., zinātniskais vadītājs Dr. ķīm. Bobrovs R. Bakalaura darbs, 41 lappuses, 21 attēli, 1 tabula, 16 literatūras avoti, 2 pielikumi. Latviešu valodā. Darbā izstrādāta “python” programmatūra mazmolekulāru organisko savienojumu šķīdumu molekulārās dinamikas trajektoriju analīzei. Izstrādātais kods ļauj raksturot molekulāro pašasociātu ģeometriju, veidu, dzīves laiku, relatīvo stabilitāti, grupēt pašasociātus pēc mijiedarbību veidiem un eksportēt pašasociātu dimēru koordinātas atsevišķā trajektorijas failā. Programmas izstrādes laikā optimizēta koda ātrdarbība, paralelizēšana un atmi…
Vairāku izmeklētu organisko reakciju pētījumi ar molekulārās modelēšanas metodēm
2015
Šajā darbā ir pētītas un analizētas butadiēna un etēna Dīlsa-Aldera reakcija, 1,5 heksadiēna Koupa reakcija, 2,3 diazabiciklo(2.2.1)hept-2-ēna deazetizēšana un N neopentilmaleisoimīda un 2,3 dimetilbutadiēna Dīlsa-Aldera reakcijas katalīze. Nosauktajās reakcijās atrasti un optimizēti svarīgākie stacionārie punkti. Modelēta Dīlsa-Aldera, Koupa un 2,3-diazabiciklo(2.2.1)hept-2-ēna deazetizēšana reakciju dinamika un secināts par UB3LYP funkcionāļa nelietderību pēdējā no šīm reakcijām. Ir izvērtēti vairāki potenciālie N neopentilmaleisoimīda un 2,3-dimetilbutadiēna Dīlsa-Aldera reakcijas katalizatori kā arī optimālākie piedāvāti tālākiem laboratorijas eksperimentiem. Molekulārās modelēšana anal…
Molekulārās dinamikas metodes pielietošana Y2O3 un FeF3 rentgenabsorbcijas spektru interpretācijai
2015
Rentgenabsorbcijas spektroskopija ir viena no eksperimentālajām metodēm, kas spēj sniegt informāciju par parauga lokālo struktūru. No otras puses, informāciju par lokālo struktūru iespējams iegūt no molekulārās dinamikas simulācijām. Šajā darbā eksperimentālie rentgenabsrobcijas spektri tiek izmantoti, lai novērtētu FeF3 un Y2O3 klasiskās molekulārās dinamikas spēka lauka modeļu kvalitāti. Labākos spēka lauka modeļus iespējams izmantot eksperimentālo rentgenabsorbcijas spektru analīzē un interpretācijā.
Nanokristāliskā itrija oksīda lokālās struktūras pētījumi
2017
Darbā tiek pētīta nanokristāliskā (2 – 50 nm) itrija (III) oksīda (Y2O3) lokālā struktūra, izmantojot dažādas eksperimentālās (rentgenstaru difrakcijas, Ramana spektroskopijas, caurejošās elektronu mikroskopijas, rentgenabsorbcijas spektroskopijas) un teorētiskās (klasiskās molekulārās dinamikas (CMD) un apgrieztās Monte-Karlo (RMC)) metodes. Rentgenabsorbcijas spektri, kas satur informāciju par materiāla lokālo struktūru, tika iegūti izmantojot sinhrotrono starojumu. Iegūtie spektri tika interpretēti, veicot teorētiskos aprēķinus uz superdatora. Darbā tiek analizēti materiālu lokālo struktūru raksturojošie lielumi atkarībā no nanodaļiņu izmēra. Salīdzinot CMD un RMC iegūtos rezultātus, tie…